PHÂN TÍCH MỐI QUAN HỆ PHÁT SINH CHỦNG LOÀI CỦA MỘT SỐ MẪU LAN Dendrobium DỰA TRÊN TRÌNH TỰ VÙNG ITS
PHÂN TÍCH MỐI QUAN HỆ PHÁT SINH CHỦNG LOÀI CỦA MỘT SỐ MẪU LAN Dendrobium DỰA TRÊN TRÌNH TỰ VÙNG ITS
Analysis of phylogenetic relationship of Dendrobium based ITS sequences
Phân tích dữ liệu trình tự ADN là cơ sở cho việc nhận diện, bảo tồn các loài Dendrobium và chọn những tổ hợp lai tiềm năng để tạo các giống lan mới có giá trị. Qua kết quả giải trình tự cho thấy, 23 mẫu giống hoa lan Hoàng Thảo đã được khuếch đại và giải trình tự vùng ITS bao gồm một phần vùng 18S, toàn bộ vùng ITS1, 5.8S, ITS2 và một phần vùng 28S, tổng chiều dài thu được từ 659 - 706 nucleotide. Dựa trên cây phát sinh chủng loài, 12 mẫu Dendrobium rừng thu thập ở khu vực phía Nam và 11 mẫu Dendrobium nhập nội từ Thái Lan tách bạch thành 2 nhóm rõ rệt. Một số mẫu lan rừng Việt Nam có tên khoa học được nhận dạng bằng hình thái trùng khớp với nhận diện bằng trình tự vùng ITS; tuy nhiên, ở một số mẫu còn chưa thể hiện sự thống nhất rõ ràng.
Analysis of DNA sequence data is the basis for identifying and preserving Dendrobium species and selecting potential hybrid combinations to create new valuable orchids. In this study, 23 Dendrobium orchids were analyzed based on DNA sequences of the nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region. The ITS region consisted of a part of the 18S region, the entire ITS1, 5.8S, ITS2 and part of the 28S region, and the length of 659 to 706 nucleotides. Based on phylogenetic tree, 12 samples of Dendrobium collected in the south and 11 samples of Dendrobium introduced from Thailand were separated into two groups. Some Vietnamese Dendrobium have been identified by the morphology that coincides with the ITS region identification. However, in some regions ITS sequence samples did not show a clear consensus between the identification and morphology marker.