NGHIÊN CỨU ĐẶC TÍNH LÝ HÓA VÀ XÂY DỰNG MÔ HÌNH CẤU TRÚC KHÔNG GIAN CỦA NHÓM NHÂN TỐ PHIÊN MÃ YẾU TỐ NHÂN Y Ở GIỐNG CHÓ DINGO (Canis familiaris dingo)

Yếu tố nhân Y (NF-Y) là một trong những nhóm protein điều hòa đóng vai trò nhân tố trung tâm trong các cơ chế điều hòa hoạt động của gen ở các loài trong sinh giới. Trong nghiên cứu này, thông tin về họ NF-Y ở giống chó Dingo (Canis familiaris dingo), bao gồm chú giải, đặc điểm lý hóa, cấu trúc gen, vùng domain đặc trưng, cấu trúc không gian, cấu trúc ARN, đã được tìm hiểu thông qua công cụ tin sinh học. Tiểu phần NFYA gồm 347 axít amin và có trọng lượng phân tử 36,88 kDa, trong khi hai tiểu phần NF-YB và NF-YC có kích thước và trọng lượng phân tử lần lượt là 207 axít amin, 22,81 kDa và 402 axít amin, 44,69 kDa. Các tiểu phần không ổn định trong điều kiện ống nghiệm và có tính ưa nước, tương tự như ở các loài sinh vật khác. Phân tích cấu trúc cho thấy gen mã hóa NF-YA, NF-YB và NF-YC ở giống chó Dingo gồm 9, 6 và 10 exon. Kết quả của nghiên cứu này đã cung cấp những hiểu biết cơ bản về nhóm NF-Y ở giống chó Dingo.

Nuclear factor - Y (NF-Y) has been considered one of the major regulatory proteins that play a central role in regulating gene expression in the kingdom. Here, the information of NF-Y in Dingo (Canis familiaris dingo), including annotation, physic-chemical characteristics, gene structure, conserved domains, 3D models and RNA structures, has been investigated by the bioinformatic approach. We found that the NF-YA subunit comprises 347 amino acids in length and 36.88 kDa in molecular weight, while NF-YB and NF-YC subunits range from 207 (22.81 kDa) to 402 amino acids (44.69 kDa), respectively. Additionally, these proteins are unstable in the test tube and hydrophilic molecules as similar as in other organisms. Next, genes encoding NF-YA, NF-YB and NF-YC of Dingo contain 9, 6 and 10 exons, respectively. Taken together, our study could provide a basic understanding of the NF-Y in Dingo.