NGHIÊN CỨU ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA ĐOẠN GEN rbcL Ở MỘT SỐ NGUỒN GEN BƯỞI VIỆT NAM
NGHIÊN CỨU ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA ĐOẠN GEN rbcL Ở MỘT SỐ NGUỒN GEN BƯỞI VIỆT NAM
Genetic diversity of rbcL gene in Vietnam’s grapefruit germplasms
Bưởi là một trong những cây ăn quả nhiệt đới quan trọng có giá trị kinh tế ở nhiều nước trên thế giới. Nghiên cứu đa dạng di truyền đoạn gen rbcL của tập đoàn 25 nguồn gen bưởi Việt Nam đã xác định được 2 trình tự nucleotit đặc trưng cho giống bưởi Thanh Trà (G2) và bưởi Da Xanh (G27). Đột biến điểm được tìm thấy là đột biến đồng hoán (C>T) tại vị trí 595 của gen ở cả 2 giống bưởi Thanh Trà (G2) và Da Xanh (G27), đột biến này có ý nghĩa trong nhận dạng các nguồn gen bưởi Thanh Trà và bưởi Da Xanh của nước ta. Hai trình tự này đã được đăng ký NCBI với số đăng ký lần lượt là KR073282 và KR073281. Phân tích cây phả hệ bằng phương pháp Neighbor Joining dựa trên trình tự của đoạn gen rbcL 600 nucleotid đã nhóm thành công được các trình tự của chi Citrus thuộc họ Rutaceae, tách biệt rõ ràng được hai giống bưởi Thanh Trà và Da Xanh của Việt Nam.
Grapefruit is one of the most important tropical fruit trees and has high economic value in many countries. Research on genetic diversity in rbcL gene of 25 Vietnam’s grapefruit germplasms has identified two specific nucleotide sequences of Thanh Tra (G2) and Da Xanh (G27). This mutation was transition mutation (C>T) at 595 downstream position of sequence in both Thanh Tra and Da Xanh and it can be used for distinguishing Thanh Tra and Da Xanh varieties from others. These two sequences have been registered with NCBI codes as KR073282 and KR073281, respectively. The phylogenetic tree analysis by Neighbour Joining method based on 600 nucleotides of rbcL gene exactly grouped all surveying sequences. In addition, this analysis has clearly separated the Citrus in Rutaceae and discriminated two grapefruits of Vietnam (Thanh Tra and Da Xanh).