NGHIÊN CỨU ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA ĐOẠN GEN matK Ở MỘT SỐ NGUỒN GEN CHUỐI VIỆT NAM

Kết quả nghiên cứu đa dạng trình tự đoạn gen matK gồm 787 nucleotid của tập đoàn 12 nguồn gen chuối Việt Nam đã xác định được đột biến đồng hoán (C>T) tại vị trí 501 của gen ở cả 2 giống chuối Tiêu Hồng (B2) và Trăm Nải (B4), đột biến này có ý nghĩa trong nhận dạng các nguồn gen chuối Trăm Nải và chuối Tiêu Hồng của nước ta. Hai trình tự này đã được đăng ký NCBI với số đăng ký lần lượt là KR073220và KR073221. Phân tích cây phả hệ bằng phương pháp Neighbor Joining dựa trên trình tự của đoạn gen matK 787 nucleotid đã nhóm được trình tự của các chi Musa, Ensete, Musella trong họ Musaceae của Bộ Zingiberales, tách biệt rõ ràng được hai giống chuối Tiêu Hồng và Trăm Nải của Việt Nam.

The survey result of genetic diversity in matK gene segment of 787 nucleotide among 12 Vietnam’s banana germplasms identified transition mutation (C> T) at 501 downstream position of the sequences in both Tieu Hong (B2) and Tram Nai (B4) cultivars which might be the molecular identification to distinguish Vietnam bananas germplasm from others. These matK nucleotide sequences from Tieu Hong and Tram Nai germplasms have been registered with NCBI codes as KR073220 and KR073221, respectively. The phylogenetic tree analysis by Neighbour Joining method based on787 nucleotides of matK gene showed that all surveying sequences were exactly divided in 2 main groups: dicot (reference sequence is Arabidopsis thaliana) and monocot (reference sequence is Oryza sativa and Zingiberales). In monocot group, this analysis successfully grouped the Musa, Ensue and Mesilla genus sequences in the Zingiberales order group. The 787 nucleotides (from 448 to 1234bp downstream) analysis discriminated clearly two banana germplasms of Vietnam (Tieu Hong and Tram Nai).