• NGHIÊN CỨU ĐA DẠNG DI TRUYỀN CÂY BÁT GIÁC LIÊN THU THẬP Ở MIỀN BẮC VIỆT NAM BẰNG CHỈ THỊ RAPD

NGHIÊN CỨU ĐA DẠNG DI TRUYỀN CÂY BÁT GIÁC LIÊN THU THẬP Ở MIỀN BẮC VIỆT NAM BẰNG CHỈ THỊ RAPD

Xem các bài khác
Số trang của bài
60-65
Bài toàn văn
Chuyên mục
Tạp chí thường kỳ
Tên bài

NGHIÊN CỨU ĐA DẠNG DI TRUYỀN CÂY BÁT GIÁC LIÊN THU THẬP Ở MIỀN BẮC VIỆT NAM BẰNG CHỈ THỊ RAPD

Tên tác giả
Lưu Thúy Hòa , Khuất Hữu Trung , Trần Đăng Khánh , Phạm Thị Lý Thu , Trần Văn Ơn
Category
Monthly Journal
Title

Study on genetic diversity of Dysosma by RAPD markers

Author
Luu Thuy Hoa, Khuat Huu Trung, Tran Dang Khanh, Pham Thi Ly Thu, Tran Van On
Tóm tắt

Bát giác liên (Dysosma Woodson) là chi thuộc họ Berberidaceae có hoạt chất berberine với hàm lượng cao và được sử dụng rộng rãi trong y học cổ truyền. Trong nghiên cứu này, 10 mẫu Bát giác được phân tích bằng 25 chỉ thị RAPD. Kết quả thu được 17 chỉ thị cho đa hình và 816 băng ADN gồm 111 loại băng khác nhau (trung bình là 6,5 loại băng/mồi), trong đó có 62 băng đa hình (55,86%) và 49 băng đơn hình (44,14%). Các băng có kích thước dao động từ khoảng 250 đến 2000bp. Giá trị PIC của 17 mồi trong khoảng 0,5 đến 0,88. Giá trị trung bình của hệ số PIC là 0,78 phản ánh các băng ADN được nhân lên là khá đa dạng. Kết quả phân tích hệ số tương đồng di truyền của 10 mẫu nghiên cứu liên dao động từ 0,57 đến 0,91. Ở mức tương đồng di truyền khoảng 0,67 có thể chia 10 mẫu nghiên cứu thành 2 nhóm cách biệt di truyền. Kết quả nghiên cứu cũng chỉ ra 9 trong số 17 mồi RAPD có thể nhận biết chính xác 5 mẫu giống nghiên cứu là PO1, PO2, PO9, PO10 và PO11. Kết quả này rất có ý nghĩa trong việc nghiên cứu tính đúng giống phục vụ công tác chọn tạo giống, nhân nhanh, bảo tồn và kiểm soát cây giống có chất lượng cao.

Abstract

Dysosma (Woodson) is a genus, belonging to Berberidaceae family. This plant contains high berberine constituent and widely used as the medicinal treatments in many countries. Ten samples of Dysosma Woodson collected from some different geographical areas in northern Vietnam, were evaluated for their genetic diversity by applying 25 different RAPD markers, of which 17 markers showed polymorphism. Total 170 PCR reactions obtained a total of 816 DNA bands that belonged to 111 different patterns (average 6.5 patterns/primer). Of which, 62 bands were polymorphic bands (55.86%) and 49 monomorphic bands (44.14%). The obtained bands sized from 250 bp to 2000 bp. PIC value of 17 primers changed from 0.5 to 0.88 with a mean of 0.78 which showed amplified DNA bands are very diversified. The analyzed result showed that samples of Dysosma in our research were very diverse. Genetic similarity coefficients of 10 samples of Dysosma ranged from 0.57 to 0.91. At genetic similarity coefficient of 0.67, total 10 studied samples was divided into 2 different genetic groups. The results showed that 9 out of 17 used RAPD primers defined exactly 5 studied samples (PO1, PO9, PO10 and PO11). This results may be useful for the classification and identification of the genus indigenous nomadic dysentery (Dysosma) for conservation and control of high quality seedlings.

Từ khoá / Keywords

Bát giác liên
Dysosma Woodson
RAPD
đa dạng di truyền
Diphtheria
Dysosma
RAPD
genetic diversity