ĐÁNH GIÁ MỐI QUAN HỆ DI TRUYỀN MỘT SỐ GIỐNG HỒNG (Diospyros kaki Linn) Ở VIỆT NAM DỰA TRÊN VÙNG GEN LỤC LẠP trnH-psbA
ĐÁNH GIÁ MỐI QUAN HỆ DI TRUYỀN MỘT SỐ GIỐNG HỒNG (Diospyros kaki Linn) Ở VIỆT NAM DỰA TRÊN VÙNG GEN LỤC LẠP trnH-psbA
Analysis of genetic relationship among persimmon varieties (Diospyros kaki L.) in Vietnam based on chloroplast trnH-psbA
Mối quan hệ di truyền giữa 9 mẫu nguồn gen hồng (Diospyros kaki L.) trồng ở bảy tỉnh của Việt Nam được đánh giá dựa trên phân tích DNA lục lạp. Việc phân tích trình tự nucleotide vùng gen trnH-psbA cho thấy rằng 9 mẫu nguồn gen hồng đã chia thành 5 nhóm; trong đó nhóm 2 gồm ba mẫu nguồn gen hồng Yên Thôn: H10, T9 và HY là các mẫu có đặc điểm di truyền giống hệt nhau với khoảng cách di truyền giữa các mẫu đều bằng 0. Kết quả nghiên cứu cho thấy có thể sử dụng vùng gen trnH-psbA như là chỉ thị DNA để nhận dạng hay đánh giá mối quan hệ di truyền giữa các giống hồng nói chung và giống hồng Thạch Thất nói riêng.
Genetic relationship among 9 samples of persimmon (Diospyros kaki L.) grown in 07 provinces of Vietnam were analyzed based on chloroplast DNA. The chloroplast trnH-psbA gene was sequenced and compared. Maximum parsimony analysis of the trnH-psbA data sets revealed that nine Diospyros species were separated into five clusters. The second cluster composed of three samples including H10, T9 with 99 bootstrap value support. Result of the study that the use of trnH-psbA gene data set could be useful indicator for genotyping characterization of Vietnamese persimmon accessions.