ĐÁNH GIÁ ĐA DẠNG DI TRUYỀN MỘT SỐ GIỐNG QUÝT ĐỊA PHƯƠNG Ở VIỆT NAM BẰNG CHỈ THỊ SSR
ĐÁNH GIÁ ĐA DẠNG DI TRUYỀN MỘT SỐ GIỐNG QUÝT ĐỊA PHƯƠNG Ở VIỆT NAM BẰNG CHỈ THỊ SSR
Genetic diversity of local tangerine (Citrus reticulata) varieties in Vietnam using microsatellite markers
Nghiên cứu thiết lập tiêu bản ADN của tập đoàn 29 giống quýt địa phương, sử dụng 30 chỉ thị SSR để nghiên cứu đa hình giữa các giống quýt. Kết quả cho thấy tổng số alen phát hiện tại 30 locut là 93 alen khác nhau, trung bình 3,1 alen/locut. Hệ số thông tin đa hình của mồi (PIC) cao nhất là 0,81, thấp nhất là 0,33, trung bình đạt 0,55; và mức độ tương đồng di truyền trong khoảng từ 0,55 đến 0,89. Tại mức tương đồng di truyền 0,55, các giống quýt nghiên cứu chia làm 2 nhóm: nhóm I gồm 24 giống có mức tương đồng di truyền từ 0,59 đến 0,89, Nhóm II gồm 5 giống có mức tương đồng di truyền từ 0,59 đến 0,78. Nghiên cứu đã xác định được 5 chỉ thị cho nhận dạng đặc trưng gồm Ci07D10, CiBE1500, CiBE0105, CiBE0246, ACT09. Các kết quả thu được có ý nghĩa trong công tác nhận dạng giống phục vụ công tác bảo tồn cũng như chọn lọc giống quýt ở Việt Nam.
DNA fingerprinting of 29 local tangerine (Citrus reticulata) varieties was investigated by 30 SSR markers. The results revealed that the total number of alleles detected in 30 loci was 93 with an average of 3.1 alleles per locus. Polymorphic information content (PIC) values varied from 0.33 to 0.81 with an average of 0.55; and genetic similarity coefficient from 0.55 to 0.89. At a genetic similarity coefficient of 0.55, tangerine varieties were divided into two groups: group I consisted of 24 tangerine varieties with genetic similarity coefficient ranging from 0.59 from 0.89; group II consisted of 5 tangerine varieties with genetic similarity coefficient ranging from 0.59 from 0.78. The research revealed 5 loci have unique alleles consisted of Ci07D10, CiBE1500, CiBE0105, CiBE0246, ACT09. The results are useful and handy for management of tangerine germplasm, tangerine variety identification and breeding programs.