ĐA DẠNG DI TRUYỀN CÁC GIỐNG BƯỞI Ở ĐỒNG BẰNG SÔNG CỬU LONG DỰA TRÊN TRÌNH TỰ ADN MÃ VẠCH VÀ DẤU PHÂN TỬ ISSR
ĐA DẠNG DI TRUYỀN CÁC GIỐNG BƯỞI Ở ĐỒNG BẰNG SÔNG CỬU LONG DỰA TRÊN TRÌNH TỰ ADN MÃ VẠCH VÀ DẤU PHÂN TỬ ISSR
Genetic diversity of pomelo varieties in the Mekong Delta based on DNA barcode and ISSR markers
Các giống bưởi ở Đồng bằng sông Cửu Long được khảo sát trình tự ADN mã vạch với 3 vùng trình tự ITS, ycf1b, psbK-psbI kết hợp với phân tích đa dạng di truyền bằng dấu phân tử ISSR. Kết quả khảo sát các vùng trình tự cho thấy các giống bưởi trong nghiên cứu tương đối đồng nhất với nhau về mặt di truyền qua phân tích các vùng trình tự ITS, ycf1b, psbK-I. Kết quả PCR với mồi ISSRK2 và ISSR22 đã khuếch đại được 19 băng ADN trong đó có 11 băng đa hình chiếm 57,89% và 8 băng đơn hình chiếm 42,11%. Dấu phân tử ISSRK2 phân biệt được bưởi da xanh với bưởi năm roi và bưởi ruby. Bưởi đường trắng và bưởi thanh kiều có hệ số tương đồng đến 95%. Như vậy dựa trên hai dấu phân tử ISSRK2 và ISSR22 đã cho thấy sự đa hình trong trình tự các giống bưởi nghiên cứu. Điều này cho thấy tiềm năng của dấu phân tử ISSR trong phân tích đa dạng di truyền các giống bưởi, phục vụ cho công tác chọn giống.
Pomelo varieties in the Mekong Delta were examined by sequencing of three DNA barcode regions, including ITS, ycf1b, psbK-psbI in combination with genetic diversity analysis by ISSR markers. The results indicated that the pomelo varieties in the study were similar in term of genetic diversity based on analyzing the sequences of ITS, ycf1b and psbK. The two ISSRK2 and ISSRK22 markers had amplified 19 DNA bands, including 11 polymorphic bands accounting for 57.89% and 8 monomorphic bands for 42.11%, respectively. The marker ISSRK2 could distinguish Da xanh from Nam Roi and Ruby pomelo varieties. Genetic similarity between Duong Trang and Thanh Kieu pomelo varieties was 0.95. Therefore, based on the ISSR markers K2 and K22 the polymorphisms of pomelo varieties were observed. The finding showed the potential of ISSR markers in analyzing genetic diversity of pomelo and could be used in pomelo breeding.